分子对接已经成为药物先导化合物发现和优化领域的有力工具。在过去的三十年中,基于不同的搜索算法和评分函数,开发了大量的对接程序。对于初学者而言,没有图形用户界面的对接程序,学习起来并不轻松,本期内容我们为大家分享一个十分易用的新的多平台分子对接工具--DockingPie。
DockingPie是PyMOL的一个插件,提供了一个通用的和用户友好的图形用户界面,可以非常方便的使用多个对接程序执行分子对接计算,同时借助PyMOL优秀的可视化能力对分子对接结果进行可视化分析。在目前的第一个版本中,实现对接的程序是Smina、AutodockVina、RxDock和ADFR,DockingPie为四个对接程序提供了一个简单的界面,即便是新手也可很轻易的完成整个分子对接流程。
下载与安装首先下载DockingPie插件压缩包,下载地址如下:
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